风雨钝剑的小窝

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——by realasking

之前投稿被拒，要更换期刊，结果在用noteexpress（NE）格式化参考文献时发现，有些引用文献的期刊名被正确缩写，有些缩写是错误的，有些则完全没被缩写。将NE自带的对应期刊的Reference Style（RS）复制了一份，然后对照csl修改未果，将几种内置缩写格式都试了一遍，也都不正确，万般无奈下决定更换Mendeley。

要更换Mendeley，需要先删除掉NE已经插入的引用。NE是采用域的形式添加引用的，在网上搜索，很多人都提到搜索全部域，然后删除即可，但是这样会伤及无辜，影响已输入公式、晶向、通讯作者等信息。最后查找微软帮助，解决问题，过程如下：

1. 在正文中显示域代码

在联想笔记本上输入：Alt+Fn+F9

在其它笔记本上输入：Alt+F9

2.打开搜索

Ctrl+H

3.搜索特定域，并用空内容替换

点击替换

点击特殊格式，在弹出菜单中选择域，此时在查找内容中出现:

^d

在其后输入 ADDIN NE.Ref.

即：^d ADDIN NE.Ref.

保持替换为中啥都没有

点击全部替换

4.关闭对话框

5.隐藏域代码

操作同1.

然后就可以看到，NE插入的东西都很轻松的干掉了。

有些忘记了，写一下，备忘。

——by realasking

In [1]: import numpy as np

In [2]: A=np.array([[1,2],[3,4]])

直接乘是对应元素相乘：

In [3]: A*A
Out[3]:
array([[ 1,  4],
        [ 9, 16]])

做矩阵乘法要用dot，下面的是A^2：

In [4]: np.dot(A,A)
Out[4]:
array([[ 7, 10],
        [15, 22]])

叉乘用cross：

In [5]: np.cross(A,A)
Out[5]: array([0, 0])

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——by realasking

很久没有写脚本了，今天处理数据，又写脚本，结果写着写着突然发现直接用了很多如x，y，z之类的变量名，结果就不如定义数组那么方便使用了，如果要改，改动的地方不少，有些费事儿，想了想，还是使用动态变量的办法来处理。

使用动态变量，其实是用read来赋值，用eval来取值，但是很久没看shell的东西了，有些手生，自己摸索了半天，终于还是弄出来了，故作个笔记，防止以后再遗忘。

假定我定义了如下的变量：

xl,yl,zl, xh,yh,zh

要对x,y,z作循环，对这些从文件赋值，就是：

j=0

for i in x y z

do

      j=$((j+1))

      sed –n ‘’”$j”’’p filename1>filename2

      read $(echo $i)l $(echo $i)h<filename2

done

如果对这些从字符串赋值，就是：

j=0

for i in x y z

do

      j=$((j+1))

      read $(echo $i)l $(echo $i)h<<<`sed –n ‘’”$j”’’p filename1`

done

在循环中取出两组已赋值的变量，并求和：

t1=`eval echo '$'"$(echo $i)l"`

t2=`eval echo '$'"$(echo $i)h"`

read $(echo $i)h<<<`echo "$t1 + $t2"|bc`

t2=`eval echo '$'"$(echo $i)h"`

sed输出由动态变量[x]linen保存的数字作行号的行：

sed -n ''"$(($(echo $i)linen))"''p filename

sed替换动态变量名所在行内容为动态变量内容和动态变量名：

A="$t1 $(echo $i)l"

sed -i '/'"$(echo $i)l"'/s/.*/'"$A"'/g' filename

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——by realasking

应该是由于我的笔记本电脑配置太低了造成的，从URL打开pdb文件一直没有响应，经过尝试，找到了如下解决办法。

1.打开Edit->Preferences->Molecule Window->Graphics

2.取消选中Hardware acceleration

3.Rendering on move选择Simplified

4.点击OK关掉对话框

然后再打开pdb文件，就一切正常了。

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——by realasking

工具下载地址：

github pypi

以前就一直觉得在命令行下切换各个目录很头疼，而且总是忘记哪些目录在用，所以后来就自己写了好几个shell脚本来管理在使用的目录，并提醒自己其中的内容。最近几天，突然萌生了把它们整理一下、打成一个包的念头，不过没有想到的是，做着做着突然觉得还不如干脆用python来整个重写一遍，结果最后就做出了这么个东西。

这个小工具是用python3.6开发的，以LGPLv3发布，兼容性并未进行多少测试，目前只在64位archlinux上使用着。它用python调用sqlite3来管理常用路径，并生成包含数据内记录路径的modulefile供Tcl版的environment module来读取，以生成新的环境变量供用户调用，而在列表显示内部的路径时，需要调用python的prettytable库，所以该工具在安装前，需要先安装配置module和prettytable。

prettytable直接用pip install prettytable即可安装。

module在archlinux上用yaourt -S env-modules-tcl安装，在安装完成后，需要在$HOME下建立文件.modulespath，其内容为存放modulefile的目录位置，然后还需要在.bashrc中添加如下两行：
export MODULEPATH=${HOME}/env/module_files:$MODULEPATH
source /etc/modules-tcl/init/bash
下次登录bash即可启用module了。

本工具所生成的modulefile叫epath，要启用它，则需要在以上两行之后另起一行，添加以下内容：

module load epath

这一步建议在本工具安装完成并至少运行一次后操作

设置完成后，用pip install essential-pathway安装本工具，然后执行ep，就可以看到各种功能的使用说明了，举个例子，比如要将当前目录加入到pathway中，并将此pathway命名为myhome，执行：

ep a myhome

然后执行:

ep l

显示：

然后执行：

[realasking@Laptop Documents]$cd ~
[realasking@Laptop ~]$module load epath
[realasking@Laptop ~]$cd "$myhome"
[realasking@Laptop Documents]$

可以看到，环境变量myhome就生效了。

同样的，该工具还支持评注（备忘）、删除、刷新、备份、卸载环境变量设置等功能，需要注意的是，每次使用该命令前，请先执行一次module unload epath，否则可能会出现一些问题，在所需操作都执行完之后，需要让所有的pathway都生效，则可以再执行一次module load epath，当然，如果将这一句导入到了.bashrc中，则重新登录shell就可以了。

有兴趣的朋友可以试试，欢迎大家提意见，但限于个人精力和能力，本人不保证此工具的有效性及稳定性，也不一定能及时回复大家的关切，还望大家海涵。